تاسس مركز الاستقلال للخرائط والدراسات الجغرافية في الجامعة بتاريخ 2018م ، ويعتبر المركز احد المراكز العلمية  التابعة لجامعة الاستقلال وهو مركز بحثي متخصص بكل ما يتعلق بالخرائط بكافة اشكالها وانواعها والدراسات الطبوغرافية المتخصصة للجامعة والمؤسسة الامنية الفلسطينية والمؤسسات الحكومية وغير الحكومية ، كما يسهم المركز في تطوير اداء العاملين وطلاب الجامعة  وجميع الفئات المعنية فيما يتعلق بموضوع الخرائط والطبوغرافيا والدراسات المتخصصة.

ويقوم المركز بالعمل على إنتاج الخرائط بجميع أنواعها لتلبية متطلبات الجامعة، وانتاج الخرائط بجميع انواعها للمؤسسة الامنية الفلسطينية ولجميع الوزارات والمؤسسات والهيئات الحكومية والمؤسسات الغير حكومية، وتقديم المعلومات المساحية الضرورية للمؤسسات المعنية، بالاضافة الى مواكبة التطور في استخدام نظم المعلومات الجغرافية والاستشعار عن بعد والعلوم المساحية، كما يقوم ايضا بتدريب مجموعة من المتدربين وذلك للاستفادة منهم في المؤسسات والوزارات المعنية، ويتخصص المركز بالقيام بمجموعة من البحوث والدراسات العلمية والموضوعية بالتعاون مع الجهات المعنية صاحبة العلاقة من المؤسسات ويعمل المركز بالمساهمة في وضع المقرارات المتخصصة بالجامعة .